mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAGCAATGCGCATGTGCGG GCCCATCCCGTTGCTCCAATA ATATAGCATCTTTCTGTCTCGCCCATCCCGTTGCTCCAATATTCTAACAACAAGTGATTATTGAGCAATGCGCATGTGCGGGATAGACTGATGGCTGC 2 2 3' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-233 1e-49 crm-mir-233 0.00000000000008 -39.4 ...(((((((..((((((((((.(((.(((((((((.((((.((...........)).)))))))))))).).))).))))))))))..))).)))). (-39.40)