mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATACTGTCAGGTAATGACGCT CGTCTTACCTGTTCAATATTTAGA TCGGTGACCGATGTCCAGCGTCTTACCTGTTCAATATTTAGACTGACTATCAAAGAGATCTAATACTGTCAGGTAATGACGCTGGATTGTCATGTCAT 2 3 3' arm Caenorhabditis_elegans mirbase 100 crm-mir-236 4e-31 -36.5 ...(((((.((((((((((((((((((((..((.((((.(((((...........)).))))))).)).))))))).))))))))).))))..))))) (-36.50)