mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGTACTACACAAAAGTACTG GCACTTTTGTGGTGTGCAAAAA GCGACAGATGCAATTTTTGTACTACACAAAAGTACTGGTCATTTAAGTTGAGGCTCAGCACTTTTGTGGTGTGCAAAAATGGCAAGTTGCTTTTATCT 3 0 5' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-239 1e-49 cbr-mir-239b 0.00000008 -37.5 (((((...(((.((((((((((..(((((((((.((((((.((......))))).))).)))))))))..)))))))))).))).)))))........ (-37.50)