mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTGGTCCCCTCCAAGTAGCTC GCTATTTGCAAGGTACCTAATTG CTGAATTCAATGTTGGAGAGCTATTTGCAAGGTACCTAATTGTTTGATTATTGATTCTCAATTGGTCCCCTCCAAGTAGCTCTATTGCATTGTTTGC 4 1 3' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-245 6e-49 cbr-mir-245 2e-23 -31.8 .......((((((...(((((((((((...((.(((.(((((...((........)).)))))))).))...)))))))))))...))))))..... (-31.80)