mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCAAGAATTAGAAGCAGTTTGGT TCACTGCTTCTTGTTTTTTCTGC GGAAGTGGCTTTGAAGCGGCAAGAATTAGAAGCAGTTTGGTGTCAGACACACTACTCACTCACTGCTTCTTGTTTTTTCTGCTTTCTTTGCTTTT 3 1 5' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-268 6e-24 cbr-mir-268 5e-21 -32.6 .((((..(....(((((((.((((((.(((((((((..((((..((.....))...)))).))))))))).)))))).)))))))..)..)))). (-32.60)