mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAATTGCCATGTGTTGGTATT TATCAATAAGCATGTCTCGTGTG TGTTGAAGTATTGCAAAAGCAAAGGACGGGCACAATTGCCATGTGTTGGTATTATTGCTTCAAGTTATTTGAAGCTGTAATATCAATAAGCATGTCTCGTGTGAAGTCCG 4 2 5' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-353 1e-56 cbr-mir-353 0.000001 -39.9 ..........((((....)))).((((...((((...(.((((((((((((((((.((((((((...)))))))).)))))))))))..))))).)...))))..)))). (-39.90)