mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAATGCCAGTCGTTGCAGGAGT CCCTACAACGCTGCGCATATGC ACGCTGTACTACTCACCAGCGGATCCCTACAACGCTGCGCATATGCATGAACACAATGAAAATGTAAATGCCAGTCGTTGCAGGAGTTCGCATACAGTAGTAAAATGCGC 4 2 3' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-357 1e-56 crm-mir-357 0.00002 -43.02 .(((..(((((((.....(((((..(((.((((((((.((((.(((((.............))))).))))))).))))).)))..)))))....)))))))....))). (-43.02)