mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACTGGTCTTTCTCTGACGAA GTTAGAGTAACACACAGTTACA AATGCTCCTTGAAATTTCAATCGTTAGAGTAACACACAGTTACACGACCTCATCAATCGTGTCACTGGTCTTTCTCTGACGAATTGAAGTTCTGGAGACAATTTTGGTTG 4 1 3' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-359 2e-46 100 -39.4 ..((((((..(((.(((((((((((((((.((.((.((((.((((((.........)))))).)))))).)).)))))))).)))))))))).)))).)).......... (-39.40)