mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCCTGCCTGGGTCACCAATTGT AATTGATGACCCAGACAAGGACT TGTCCTGAAGGCAGGCAATTGATGACCCAGACAAGGACTAATCAAGATTGTCGATCTAGTCCCTGCCTGGGTCACCAATTGTCGGCCCCCGCGGGCA 3 0 3' arm Caenorhabditis_elegans mirbase mir-789 2e-30 cel-mir-789-2 1e-31 -49.1 .((((((..(((.((((((((.((((((((.((.(((((((((.........))).)))))).)).)))))))).)))))))).)))..)).)))). (-49.10)