mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACTGGAAGTGTTTAGGAGTAA ACCCCTAACCCTATGCAGTATT CTTTGACCTGAACGTCACCCCTAACCCTATGCAGTATTTGGAGCTCATAAAATACTGGAAGTGTTTAGGAGTAATGCTCAGTTGTCAGAA 4 2 3' arm Caenorhabditis_elegans mirbase 100 100 -26.8 .((((((((((.(((.((.(((((.(((.(.((((((((.(....)...)))))))).))).).))))).)).))).))))..)))))). (-26.80)