mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTTGGCCGTGGTGAACACTTCCGCC TGGCAGTGTTTCTCCCCCAACTT GTTCACCAGAGTTGGCAGTGTTTCTCCCCCAACTTTTGTTACAGAATTGCAAAAATGTTGGCCGTGGTGAACACTTCCGCCTCTGGTTTGAAG 3 4 3' arm Caenorhabditis_elegans mirbase 100 cel-mir-1824 7e-48 -32.8 .((((((((((.(((.(((((((..((((((((((((((.........))))))..)))))..).)).))))))).))).)))))))..))). (-32.80)