mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAAGTGATACCAGACCGCTAGT TGGCGGTTTGCATTCACTTACA TACATTTATTCTTACTGTCCTCGAATACAAACTGGCGGTTTGCATTCACTTACATTTATAAGACAAAAATGCAAGTGATACCAGACCGCTAGTTTGTAAAAGGGATAATTTTATGTGA 4 0 3' arm Caenorhabditis_elegans mirbase 100 100 -42.46 (((((..........((((((....(((((((((((((((((...((((((.(((((.........))))).))))))...)))))))))))))))))...)))))).....))))). (-42.46)