mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCCTGAGACCTCAAGTGTG CGCCTGGGCTCTCTGGGTAC ATGTTCTGATGCTTTCGGCCTGCTCCCTGAGACCTCAAGTGTGAGCGCACTGTTGATGCTTCACGCCTGGGCTCTCTGGGTACCAGGACGGCTTGAGCAGACAT 4 0 5' arm Caenorhabditis_remanei mirbase lin-4 8e-33 cel-lin-4 1e-28 -42.1 (((((....((((((((.((((..(((.((((.((((.(((((((.((((....).)))))))))).)))).)))).)))...)))).)))...)))))))))) (-42.10)