mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGATGTGC CCGTCAAAGTGGCTCGTGTTATG ATAGTATACGGAAAGCCCGTCAAAGTGGCTCGTGTTATGTTGAATCTTGAAGTAATCATATCACAGCCAGCTTTGATGTGCTTCCTGAAGTACTAT 2 2 3' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-2 1e-34 cel-mir-2 0.000000005 -35.03 (((((((.(((.((((.(((((((((((((.(((.((((.................)))).)))))))).)))))))).)))).)))..))))))) (-35.03)