mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACCGGGTGAAAATCAGGGC ACTGGTTTTCGCTGCGGTGATA TCGGTCGGATCGGACCTACACTGGTTTTCGCTGCGGTGATACTTCGAGAATGATTATCACCGGGTGAAAATCAGGGCAGGTCCGATTCCACCGA 2 1 3' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-36 3e-47 crm-mir-35c-3 1e-31 -55.2 (((((.(((((((((((.(.((((((((((((.((((((((..((......)).)))))))))))))))))))).).))))))))))).))))) (-55.20)