mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACCGGGTGAAAATCAGGGC CACTGATTTTCGCTTCGGTGATA CCTATTATCTGGTCGGATCGGACCTCCACTGATTTTCGCTTCGGTGATATTTCAAGAACGATTATCACCGGGTGAAAATCAGGGCAGGTCCGATTCCCCATTCCCGGCTGGATTGGA 1 2 3' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-36 1e-47 crm-mir-35c-3 8e-33 -61.6 ((....(((..((((((((((((((((.((((((((((((.((((((((..((......)).)))))))))))))))))))))).))))))))).........)))))..))).)). (-61.60)