mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACCGGGTGAAAATCAGGGC CACTGGTTTTAGCTTCGGTGATA TCGGTCGGATCGGACCTCCACTGGTTTTAGCTTCGGTGATATTTCTAGAATGATTATCACCGGGTGAAAATCAGGGCAGGTCCGATCCCATCGAT 2 2 3' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-36 1e-31 crm-mir-35c-2 6e-33 -54.5 (((((.(((((((((((((.((((((((.(((.((((((((..((......)).))))))))))).)))))))))).))))))))))).))))). (-54.50)