mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACCGGGTGAAAATCAGAGC ACTGGTTTTCGCCTCGGTCATA AGGTCGGATCGGCCCTCCACTGGTTTTCGCCTCGGTCATATTTCAAGTATGATTATCACCGGGTGAAAATCAGAGCAGGGCCGATTCCACC 3 1 3' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-36 2e-45 crm-mir-35d-2 9e-32 -51.2 .(((.(((((((((((.(.((((((((((((.((((.(((..(((....))).))).)))))))))))))))).).))))))))))).))) (-51.20)