mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACCGGGTGGGCATTGGTTCT TGCTGATGCCGACCTTGGTAATA ATTGCACTTGACGACGGGAACAGTGCTGATGCCGACCTTGGTAATAGGACTAAACTGTGACAAGCTATCACCGGGTGGGCATTGGTTCTGGTCCCTTAGTCATCCTATTGTGAT 5 1 3' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-36 1e-53 crm-mir-35g 2e-27 -43.13 ((..((..((((...((((.(((.((..(((((.((((.(((.((((.................)))).))))))).)))))..)).))).))))...))))......))..)) (-43.13)