mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACCGGGAGTAAAACTGGTAT ACCGGTTTAACTTCGTGGTGATA TCCGATTGGTTGAAAGAGCCAGAACCTATACCGGTTTAACTTCGTGGTGATATGACACATATTACATTCTTTATCACCGGGAGTAAAACTGGTATAGGATCTGCGACTCGCTGATTGGAA 1 1 3' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-36 1e-53 100 -53.91 ((((((..((.....((((((((.(((((((((((((.(((((.((((((((...................))))))))))))).))))))))))))).)))).).)))))..)))))). (-53.91)