mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACCGGGTGTACATCAGCTAG AGTTGATGTTCATCGCAGTGATA TGGTATCTTCAAACCCTGCCCGTAACCTAGTTGATGTTCATCGCAGTGATATGACGCATCAGTACATTCCTTATCACCGGGTGTACATCAGCTAGGGTGCGGGTTCAGGTTCTTTATCAT 2 1 3' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-36 1e-53 cbr-mir-40 0.00000000003 -48.4 (((((......((((..(((((((.((((((((((((.((((.(.((((((((((......)).)).....)))))).))))).)))))))))))).)))))))...))))...))))). (-48.40)