mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCACCGGGTGAAAAACTACC TAGTTTTCCGCCGCAGTGATA GAAAGGTAAGTTTAACAGGTCCCCATGACCTTGGTAGTTTTCCGCCGCAGTGATATACCATCAATCAAAACGATATCACCGGGTGAAAAACTACCAAGGTCGGGTCACCTGTCCTTTT 2 1 3' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-36 5e-53 cbr-mir-41 0.000000000006 -52.59 ((((((........((((((..((.((((((((((((((((.((((.(.(((((((................))))))).))))).))))))))))))))))))..)))))))))))) (-52.59)