mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGTTTACTTGCTGTCGC GACAACAAGAAACTTGTGATTATG AGGCGATTCTGCCCGTGACAACAAGAAACTTGTGATTATGCCTAGAGAATGAAGAAGGGACATATCACAGTTTACTTGCTGTCGCAGGCGGTGTCATCTG 1 3 3' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-43 9e-51 cbr-mir-43 0.000000000000001 -40.22 ((..(((.(((((.((((((.(((((((((.(((((.((((((.............))).))))))))))))).)))).)))))).))))).)))..)). (-40.22)