mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATATGTCTGGTATTCTTGGGTT CCAAAGTAGCAGACGTATCGAC CCCACCCCCTGGCCGCTGATATGTCTGGTATTCTTGGGTTCGATACTCTGAAAAACGAACCAAAGTAGCAGACGTATCGACGGCCGGGAGGGTGGG 3 2 5' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-50 2e-48 cel-mir-50 0.0000000003 -60.12 (((((((((((((((.(((((((((((.((((....((((((.............))))))..)))).))))))))))).)))))))).))))))) (-60.12)