mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CACCCGTACATATGTTTCCGTGCT CACGTTACAATATATGGGTCGC TACCCTCTACTACCGTCCACCCGTACATATGTTTCCGTGCTTGACATTGTGCTCAATCACGTTACAATATATGGGTCGCCGGTCTTAGGCGGT 5 2 5' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-52 5e-46 crm-mir-52-2 7e-48 -30.2 .(((.((((..((((.(.(((((((.((.(((...((((.((((........)))).))))..))))).))))))).).))))..)))).))) (-30.20)