mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTAACTCGTCGGTAGTCATTGTT CTATGACACTGAAGCGAGTTAGAAA TTCCTCCAACATGTCAGAAAACATCCACTTCTAACTCGTCGGTAGTCATTGTTTCCATAAACCAGGAAGTGAAACTATGACACTGAAGCGAGTTAGAAATGGTGATTCTGTGGCGAAG 1 3 5' arm Caenorhabditis_remanei mirbase 100 cel-mir-63 0.000001 -37.7 ...(.(((......(((((..((.(((.(((((((((((((((.(((((.((((((............).))))).)))))))))..))))))))))).))))).)))))))).)... (-37.70)