mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGACACTGTTGCGTAGCATG GACTACGCTCAGTGGAATACC CAGAAGGCCTCGCCGAATATGACACTGTTGCGTAGCATGACCAATGAGACTCTACAAAAGAGTGAATGGATCTGACTACGCTCAGTGGAATACCCGGCGAGTGCCTTCT 4 2 5' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-64 4e-56 crm-mir-64c 0.000005 -55.1 .((((((((((((((..(((..(((((..((((((((.(((((.....(((((.....)))))...))).)))).)))))).)))))..)))..))))))).))))))) (-55.10)