mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGACACTGACGCTTAATATGG ATAAAAGCTCAGTGTCAAACT ATACATTAACCAGAGGCCTCGCCGAATATGACACTGACGCTTAATATGGACCGATCTCCCCCGGATCCATAAAAGCTCAGTGTCAAACTCGGCGAGTGCCCCGCCCCCTAATTGTATT 2 2 5' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-64 1e-53 crm-mir-64a 0.000006 -52.33 (((((.......(.(((((((((((.(.(((((((((.((((..(((((((((........))).)))))).))))))))))))).).)))))))).))).)..........))))). (-52.33)