mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGCAAGATGTTGGCATAGCTG GCTCGGCCACATACTGCCACG CCGTAAGACTCGTCAAAGCTAGGCAAGATGTTGGCATAGCTGAATGCAATTTGGCGCTCAGCTCGGCCACATACTGCCACGCATTGGCTAGAGTCTAATTTTTATCCCTATGG 5 1 5' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-31 2e-39 cel-mir-72 0.00000000002 -44.2 ((((((((((((((((.((..((((..((((.(((..((((((.(((......))).))))))..)))))))..))))..)).)))))..))))))............))))) (-44.20)