mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGCAAGACAAGGCAGTCTAC GGGCTTCCTCATCTTTCCCAGC CAGCCCGCCACACATATGGGCTTCCTCATCTTTCCCAGCGAAACTACTAATTACGCTGGCAAGACAAGGCAGTCTACATGTGTGGCGGTGCT 5 1 3' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-74 5e-46 cbr-mir-74b 0.0003 -49.02 .((((((((((((((.((((((.(((..((((..((((((.............)))))).))))..))).)))))).))))))))))).))) (-49.02)