mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCATCAGGCCATAGCTGTCC ATGGCTGTGCTCTGAGGAAAC TTCAAAATAAAAAGAGCTGTTAGTTTGGATGGCTGTGCTCTGAGGAAACACGGTGTCATTTCATCAGGCCATAGCTGTCCAAAACTCGTTTCCCCACTAAAGCGGTTAAGAGGTTTTGGA 3 0 3' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-77 4e-44 crm-mir-77-1 1e-19 -37.3 ((((((((......(((((((..((((((((((((((..((((.((((..........)))).))))..))))))))))))))....((......))...))))))).....)))))))) (-37.30)