mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTTTGTAATGCTGTCG ACATCATTTCAACTGCCTCGGC TACGAAACAGTCTAACAGAAGCATCTGAGGTAGTTTGTAATGCTGTCGACGCACTGTAATGTCTACATCATTTCAACTGCCTCGGCTGTTTTTAGACTTTTGTTTTGT 3 1 5' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-84 1e-50 cbr-mir-84 0.000000000001 -41 .(((((((((((((...((((((.(((((((((((.(.((((.(((.((((........)))).))).)))).)))))))))))).)))))))))))...)))))))) (-41.00)