mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGTGAATGCTTTGCCACAGTC CTGGGCTAAGATTCGCTTAGG ACGAGTCGGCGCCGTCTAAGTGAATGCTTTGCCACAGTCTTCGACCATGTCAAATGAAGCCTGGGCTAAGATTCGCTTAGGCCGGCGTTTTTCGACACGG 2 2 5' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-86 1e-49 cbr-mir-86 2e-27 -46.8 .((.(((((((((((((((((((((.(((.(((.(((.(((((((...)))....)))).)))))).)))))))))))))).))))))....)))).)). (-46.80)