mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATATGTTGTTTGAATGCCCCT CGGTATTCAACGACTATCTCAAC TGTTTGGGCCTCACTTCGAGCGGTATTCAACGACTATCTCAACCGATATACATACCAACCGAGTTGATATGTTGTTTGAATGCCCCTTGAACTCGAGGCCCCTAGTAAACA 2 2 3' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-90 3e-48 cel-mir-90 0.000000001 -42.94 .(((((((((((..((((((.(((((((((((((.((.(((((((..............)).))))).)))))).))))))))).))))))...))))))).....)))). (-42.94)