mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTATTAGTTGTGCGACCAGGAG CTTGGTCGACAATCTAATATTA GATGTTGTACCGATACTTGGTCGACAATCTAATATTATCGGTTCTGCCAGAAGATAGTATTAGTTGTGCGACCAGGAGACGGTATTTAACATCA 2 2 3' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-230 3e-47 cel-mir-230 0.00000000002 -42.3 ((((((((((((...((((((((((((.(((((((((((((.....))....))))))))))))))).))))))))...))))))..)))))). (-42.30)