mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGAGCAATGCGCATGTGCGGG CGCTCATCCTGTTGTTCCAATA TGAAGCGTCTCTCTGTCCCGCTCATCCTGTTGTTCCAATATTCCAACAGCCCAGTGATTATTGAGCAATGCGCATGTGCGGGACAGATTGTATGCTGCCAT 2 2 3' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-233 1e-49 cel-mir-233 0.00000000000008 -38.8 ((.((((((..((((((((((.((((.((((((((.((((.((..((......)))).)))))))))))).).))).))))))))))..).)))))..)). (-38.80)