mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAGGTAGGTGCGAGAAATG TTGTCTCGCAGCTGCTTCAAC CAAAAAAGCGACGTGTCAAAGTAGAGGTAGGTGCGAGAAATGACGGAACCTCACAAATCATCGTTCATTGTCTCGCAGCTGCTTCAACTGTGCCCACTGACGCAAATCAACTTTTTT 2 1 5' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-241 5e-50 cel-mir-241 0.000000000006 -36.54 .......(((.((((.((.(((.(((((((.(((((((((((((((..............))).))))).))))))).))))))).))).))..))).).))).............. (-36.54)