mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTGGTCCCCTCCAAGTAGCTC GCTGCTTGCAAGGTACCTAATTG AAAGTACTCAATGTCGAAGAGCTGCTTGCAAGGTACCTAATTGTTTGCACATTTCTCAATTGGTCCCCTCCAAGTAGCTCTATTGCATTGTTTGTTTTA 4 1 3' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-245 5e-31 cbr-mir-245 4e-31 -31.52 ((((((..(((((.((((((((((((((...((.(((.(((((.............)))))))).))...))))))))))).))))))))..)))))). (-31.52)