mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTACACGTGCACGGATACGCTC GCGATATCCAGCCGTTGTATTC GCTAGTATTTTTTGGCAGAGATTACGATTAGCGATATCCAGCCGTTGTATTCAATAGCGCATTTGAGTACACGTGCACGGATACGCTCATCGTTTTTGTATTGCCACTTCGATTGAGT 2 4 3' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-248 2e-52 cel-mir-248 0.000000000006 -40.47 (((.........((((((.((..(((((.((((.(((((.(((((.((((((((........))))))))))).))..))))))))).)))))..))...)))))).........))) (-40.47)