mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATCACAGTCACCTGATGGT CTTCAGTTGACTCGTGATCCG GCTGTTATTCGAAGGTCTTCGGACCGCCCCTTCAGTTGACTCGTGATCCGCCGACTTTGATATATGGACGAATCACAGTCACCTGATGGTACGGTCTTTGAATTCCTATATTATTATGGT 4 1 3' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-250 3e-39 cbr-mir-250 0.0000000000004 -39.46 (((((.......(((..(((((((((..((.((((.(((((.(((((.(((((...........))).)).)))))))))).)))).))..))))))..)))..)))........))))) (-39.46)