mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAATCTCATCCTAATCTGGTTGAC TACCGATTTGGCTTGGGATTGAC AGCCGACGGAACGAGTAAATCTCATCCTAATCTGGTTGACACAACACAAGGAAGTGCTACCGATTTGGCTTGGGATTGACTTGTGGAAATGGCT 5 2 5' arm Caenorhabditis_remanei mirbase mir-259 3e-47 cbr-mir-259 0.000000001 -31.2 (((((.....((((((.(((((((.((.((((.(((.(.(((..(.....)..)))).))))))).))..))))))).)))))).....))))) (-31.20)