mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGTTCGCGTTGCTCAACCAC GGTGAGCCACGTTGGCGCAAATC CGCTCCAATTCGATGTGGTGAGCCACGTTGGCGCAAATCTCAGTCATTTTCGATGATTTGTTCGCGTTGCTCAACCACATCGATGGCAAAAGCG 1 3 3' arm Caenorhabditis_remanei mirbase 100 cel-mir-356 0.000000001 -39.7 (((((((..((((((((((((((.((((.((.(((((((...(((......)))))))))))))))).)))).)))))))))))))....)))) (-39.70)