mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGTGAATATTCTGTGTCG GCGCAGAATTTTTTCGCTTACA GAAACCGCTCTTTTTTGTCCGTCAGCGCAGAATTTTTTCGCTTACACGAGTAATGTAAACGATGTAAGTGAATATTCTGTGTCGATGGGTATAAAAAGATAATGATGGTTT 2 2 3' arm Caenorhabditis_remanei mirbase 100 cbr-mir-785 0.0003 -41.4 .(((((((((((((((..(((((.(((((((((...((((((((((((...........)).)))))))))).))))))))).)))))..).)))))))....).)))))) (-41.40)