mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTTATCTAGCTGTATG TAAAGCTGGAAAACTGAAGGAA TTCCTTCAATGGGACAGTCATTATCGTCTCTTTGGTTATCTAGCTGTATGATTTGAAATGTAAATCATAAAGCTGGAAAACTGAAGGAACGATGTGTCTCATGGA 5 0 5' arm Pristionchus_pacificus mirbase mir-9 2.0E-27 cte-mir-79 5.0E-9 -44.8 .(((....((((((((.....((((((..(((..(((.(((((((.(((((((((.....))))))))).))))))).)))..)))..))))))))))))))))) (-44.80)