mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTTATCTAGCTGTATG TAAAGCTGGAAAACTGAAGGAA TTCCTTCAATGGGACAGTCATTATCGTCTCTTTGGTTATCTAGCTGTATGATTTGAAATGTAAATCATAAAGCTGGAAAACTGAAGGAACGATGTGTCTCATGGA 5 0 5' arm Pristionchus_pacificus mirbase mir-9 2e-27 cte-mir-79 0.000000005 -44.8 .(((....((((((((.....((((((..(((..(((.(((((((.(((((((((.....))))))))).))))))).)))..)))..))))))))))))))))) (-44.80)