mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTCATGGAGTCGCTCTCTTC AGAGAGCCTTCTGTTGACAGT ACCCCCGGCACCACGCAGAGACCGAAGAGAGCCTTCTGTTGACAGTGCGGGCCGTTGGTGCTAATGCTATTGTCATGGAGTCGCTCTCTTCAGGCTTGTGGTCCTCAGGGT 1 4 3' arm Pristionchus_pacificus mirbase mir-46 1e-37 crm-mir-46 0.000005 -48 ((((..((.(((((...(((.(((((((((((((((...(((((((((.((((....).)))...)).))))))).))))..))))))))).))))))))))))...)))) (-48.00)