mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGACACTCAATGCGAGATGGG CATTCGCATGAGTTTCATGGA GGTACCCGAACCATAATCCATGTGGGGTTCCATTCGCATGAGTTTCATGGACTCGATTCATAGATCTATGACACTCAATGCGAGATGGGACCTCGGTGGACCAATGGTTCGGTACC 1 2 3' arm Pristionchus_pacificus mirbase mir-63 3e-60 ppc-mir-63c-2 4e-59 -64.1 ((((((.(((((((..(((((.(((((((((((((((((((((.(((((((.((........))))))))).)))).)))))).))))))))))))))))...))))))))))))) (-64.10)