mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGGTAGTTAAGAATATGTG CTTATTCTTCCTGCCTCACC TCCCTTCCAATCGATACCACAGTTGAGGTAGTTAAGAATATGTGATGCCTTTCGGGAATCATTCACTTATTCTTCCTGCCTCACCTGTGACGATGGAATCGGA 2 1 5' arm Pristionchus_pacificus mirbase 100 ppc-mir-84a 0.0000003 -40.5 (((.(((((.(((....(((((.((((((((..(((((((.((((..((.....))......)))).))))))).)))))))).))))).))))))))..))) (-40.50)