mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGACACCTGGGCGAACTGTCC ACGGTTCCCTGGTGGCATGGT CTGAGAGACCCATCCGATCCTGAACGGTTCCCTGGTGGCATGGTCGATACTAATGAGCGAACTATGACACCTGGGCGAACTGTCCAGGCGGGGTTTCCAA 2 2 3' arm Pristionchus_pacificus mirbase 100 ppc-mir-2232-2 0.000001 -43.5 .((.(((((((...((..((((.((((((((((((((.((((((((...(....)..)).)))))).)))).))).))))))).))))))))))))))). (-43.50)