mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATGACAGATCAGTGCGCGAG CCCATTCACTCTTCTCGTCAGTCG TTATTCTGGTATCTAGTCGATCCTCTTTCCCATTCACTCTTCTCGTCAGTCGATGATTGAATATCGAATGACAGATCAGTGCGCGAGAAGGAAGACTAGCTTCCGTGATGG 5 3 3' arm Pristionchus_pacificus mirbase mir-2238 2e-49 ppc-mir-2238a-4 1e-56 -36.1 .((((.(((...((((((..((((.((((.(...((((..(((.((((.((((((......)))))).)))))))..)))).).)))))))).))))))...))).)))). (-36.10)