mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATGACAATCGAGTGGGTGAG CGTCTACTCCTTTCGTCATTGA GGAACTAGTCTGCCGACTTCCCGTCTACTCCTTTCGTCATTGATACGAATTCGAATGACAATCGAGTGGGTGAGAAGGAAGACTTGCTTCC 5 1 3' arm Pristionchus_pacificus mirbase mir-2238 2e-45 ppc-mir-2238b-1 4e-34 -30.5 (((((.(((((.....((((.(..((((((..((.((((((((.......)).))))))))..))))))..).))))..))))).).)))) (-30.50)